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Tempo per un quiz: cosa sono le distribuzioni Linux scientifiche?
La risposta è piuttosto ovvia: mentre la maggior parte delle distribuzioni Linux sono generiche, alcune specializzate vengono fornite in bundle con determinati tipi di software. Ad esempio, ci sono le distribuzioni dei media center, quelle che trasformano il tuo computer in uno studio di produzione multimediale, e anche alcune distribuzioni religiose. Sapendo questo, non dovrebbe sorprenderti che esistano distribuzioni Linux scientifiche. Dopotutto, la storia di Linux è iniziata nei laboratori di ricerca e oggi Linux alimenta i server e le workstation delle più grandi organizzazioni di ricerca del mondo.
In poche parole, le distribuzioni scientifiche offrono software preinstallato per vari scopi di ricerca. Naturalmente, puoi trasformare la tua normale Ubuntu in una distribuzione scientifica installando quelle stesse app, ma il punto di tali distribuzioni è evitare la ricerca di singole applicazioni. Invece, forniscono un modo rapido per distribuire Linux nelle strutture di ricerca, negli istituti di istruzione e sui personal computer di studenti e utenti appassionati di scienza. Se sei tra questi ultimi, ecco cinque grandi distro scientifiche da considerare.
1. Bio-Linux
Questa distribuzione di colore verde è rivolta agli scienziati che lavorano nella bioinformatica, un campo interdisciplinare che combina biologia molecolare e genetica con statistiche e metodi di analisi dell'informatica. Sviluppato presso l'Environmental Omics Synthesis Centre nel Regno Unito, Bio-Linux è supportato e finanziato dal Centre for Ecology & Hydrology (CEH) e dal Natural Environment Research Council (NERC).
È una distribuzione basata su Ubuntu disponibile solo per sistemi a 64 bit e offre due ambienti desktop: Unity come predefinito e MATE come alternativa leggera. L'ultima versione (8.0.5) garantisce un supporto a lungo termine grazie al suo core Ubuntu 14.04. Bio-Linux 8 racchiude letteralmente centinaia di strumenti bioinformatici, sia a riga di comando che grafici. Per aiutarti a iniziare, Bio-Linux offre una guida in PDF .
Caratteristiche principali del software: Artemis, un visualizzatore di sequenze di DNA e un'app di annotazione; Galaxy, una piattaforma di ricerca biomedica basata su browser; Fasta, per la ricerca di database di DNA e proteine; Mesquite, per la biologia evolutiva; njplot, per disegnare alberi filogenetici, e Rasmol, per visualizzare macromolecole. Se vuoi installare pacchetti da Bio-Linux sul tuo sistema basato su Ubuntu, puoi semplicemente aggiungi i loro repository .
Bio-Linux è disponibile gratuitamente come immagine Live e come file OVA nel caso in cui desideri eseguirlo in VirtualBox.
Alternativa: BioSLAX, una distribuzione scientifica basata su Slackware incentrata sulla bioinformatica e sviluppata presso la National University of Singapore.
2. Poseidon Linux
Come Bio-Linux, anche Poseidon Linux ha una combinazione di colori: delicati toni di blu che corrispondono al suo nome marino. Il marchio è stato ispirato dagli oceanologi che lavorano al progetto, ma Poseidon Linux non è solo per un ramo della scienza. Offre invece una vasta gamma di strumenti, dalla visualizzazione 2D e 3D, la genetica e le app di programmazione al supporto per statistiche, modellazione numerica e mappatura.
Poseidon Linux è il risultato di una cooperazione transatlantica tra la Rio Grande Federal University in Brasile e l'Istituto MARUM in Germania. L'attuale versione stabile (4.0) è in ritardo rispetto ai tempi, poiché è basata su Ubuntu 10.04. Tuttavia, Poseidon 5.0 è in fase di sviluppo e promette supporto a lungo termine (basato su Ubuntu 12.04) e Unity come ambiente desktop predefinito, un gradito aggiornamento dal vecchio GNOME 2.30 fornito con Poseidon 4.0.
Caratteristiche principali del software: Lab Plot, per la rappresentazione grafica interattiva e l'analisi dei dati; QCAD, per il disegno 2D; Blender, per la modellazione 3D, e QGIS, un sistema informativo geografico completo.
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Puoi scarica Poseidon Linux gratuitamente in entrambe le edizioni a 32 e 64 bit.
Alternativa: Se hai solo bisogno di strumenti di geografia e mappatura, prova OSGeo , un prodotto basato su Lubuntu della Open Source Geospatial Foundation.
3. CAElinux [non più disponibile]
L'indizio è nel nome: CAE sta per Computer-Aided Engineering e questa distribuzione scientifica è perfetta per chiunque lavori con CAD, modellazione, prototipazione, stampa 3D e simulazioni fisiche. Sviluppato in Svizzera, CAElinux è basato su Xubuntu 12.04 e richiede un sistema a 64 bit. Non offre alcun tipo di desktop a parte Xfce, ma la sua selezione di software è impressionante.
Caratteristiche principali del software: Salome, per CAD 3D e meshing; GMSH, per la modellazione geometrica; Scilab, per la programmazione matematica; Paraview, per la visualizzazione 3D; ImageJ, per l'elaborazione e l'analisi delle immagini, ed Elmer, per modelli fisici complessi.
CAElinux è disponibile gratuitamente come immagine Live DVD, oppure è possibile ordinare una copia fisica a un prezzo accessibile.
Alternativa: Se non hai bisogno di tutto il software di ingegneria avanzata e desideri solo alcuni strumenti di modellazione e animazione 3D, prova ArtistX, che abbiamo trattato in dettaglio.
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Quattro. Linux scientifico
Dopo tutte queste distribuzioni basate su *buntu, Scientific Linux è un vero combo-breaker: è una ricostruzione di Red Hat Enterprise Linux. L'ultima versione (7.1, nome in codice Nitrogen) è uscita solo di recente, in tre versioni: KDE, GNOME e IceWM, solo per sistemi a 64 bit. Tuttavia, la sua base non è l'unica cosa che distingue Scientific Linux. A differenza di altre distribuzioni piene di software scientifico, Scientific Linux offre solo un set di app di base. Che distro subdola e fuorviante!
Beh, non proprio. Scientific Linux è, infatti, sviluppato da scienziati del Fermi National Accelerator Laboratory e dell'Organizzazione europea per la ricerca nucleare (CERN). Sebbene non offra molte applicazioni scientifiche per impostazione predefinita, ce ne sono dozzine prontamente disponibili nei repository. Con codec e supporto wireless pronti all'uso, Scientific Linux è un'ottima scelta per un ambiente scientifico in cui tutto dovrebbe funzionare senza troppi armeggi. Gli utenti possono installare solo il software di cui hanno bisogno, così il loro sistema non sarà ingombrato da app che non apriranno mai.
Caratteristiche principali del software: PostgreSQL e MySQL, per database e sviluppo di applicazioni; editor di testo GNU Emacs; linguaggio di programmazione R; Frysk, per l'analisi e il monitoraggio del sistema, e gnuplot, per tracciare espressioni matematiche. (Nota che alcune di queste app non verranno installate per impostazione predefinita, ma puoi prenderle dai repository.)
Scientific Linux può essere scaricato come a Immagine del DVD dal vivo .
Alternativa: Gli sviluppatori di Scientific Linux incoraggiano la creazione di 'spin' o build basati sul loro progetto. Una di queste distro è Fermi Linux ; una buona opzione incentrata sulla sicurezza per coloro che desiderano eseguire Scientific Linux su un sistema a 32 bit.
5. Fedora Scientific
Questo spin di Fedora rappresenta la via di mezzo tra una distribuzione Linux altamente specializzata e una normale. In quanto tale, è ottimo per ricercatori e studenti di tutte le provenienze scientifiche, sebbene inclini leggermente a favore della ricerca basata sui numeri. L'ambiente desktop predefinito è KDE e Fedora Scientific è disponibile per architetture sia a 32 bit che a 64 bit. È sviluppato da Amit Saha con il supporto di Fedora Science and Technology SIG. Bellissimo documentazione in linea ti introdurrà a Fedora Scientific e ti guiderà attraverso la sua selezione del software.
Caratteristiche principali del software: Maxima, una suite di algebra completa; LaTeX, per la creazione di documenti e presentazioni; Mayavi, per la visualizzazione dei dati 3D, e la tripletta di controllo della versione: git, Mercurial e Subversion.
Puoi scaricare Fedora Scientific Live DVD tramite download diretto o come torrent.
Alternativa: Se stai cercando una distribuzione scientifica intuitiva incentrata sulla matematica, Mathbuntu è un ottimo sostituto di Fedora Scientific. È disponibile come distribuzione autonoma o come set di pacchetti per l'attuale installazione di Ubuntu.
Indipendentemente dal campo scientifico a cui sei interessato, dovresti essere in grado di scegliere una distribuzione adatta da questo elenco. Ora, tornando a quel quiz pop— qual è la tua distribuzione Linux scientifica preferita? Puoi nominare altre distribuzioni simili che meritano un posto in questa lista? Fai i compiti e condividi i tuoi consigli nei commenti.
Crediti immagine: Immagine in primo piano , Muro di monitoraggio basato su Nagios nel NOC tramite Flickr di Docklandsboy , Schermata di Poseidone , Schermata CAElinux, Linux scientifico tramite Wikimedia Commons , Schermata di Fedora Scientific.
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Ivana Isadora è una scrittrice e traduttrice freelance, amante di Linux e fan di KDE. Supporta e promuove software gratuito e open source ed è sempre alla ricerca di app fresche e innovative. Scopri come metterti in contatto qui .
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